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手術室的空氣壓力根據其不同區域（如手術間、無菌準備間、刷手間、麻醉間和周圍干凈區域等）潔凈度不同要求而不同。不同級別的層流手術室其空氣潔凈度標準不同，例如美國聯邦標準1000級為每立方尺空氣中≥0.5μm的塵粒數，≤1000顆或每升空氣中≤35顆。10000級層流手術室的標準為每立方尺空氣中≥0.5μm的塵粒數，≤10000顆或每升空氣中≤350顆。依次類推。手術室通風的主要目的是排除各工作間內的廢氣；確保各工作間必要的新鮮空氣量；去除塵埃和微生物；保持室內必要的正壓。 能滿足手術室通風要求的機械通風方式有以下兩種。機械送風與機械排風并用式：這種通風方式可控制換氣次數、換氣量及室內壓力，通氣效果較好。機械送風與自然排風并用，這種通風方式的換氣及換氣次數受一定限制，通風效果不如前者。手術室的潔凈級別主要是以空氣中的塵埃粒子數和生物粒子數來區分。目前，最常用的是美國宇航局分類標準。凈化技術通過正壓凈化送風氣流控制潔凈度來達到無菌的目的。

根據送氣方式不同，凈化技術可分為紊流系統和層流系統兩種。(1)紊流系統(Multi－Directional Manner)：紊流系統的送風口及高效過濾器設于頂棚，回風口設于兩側或一側墻面下部，過濾器和空氣處理比較簡單，擴建方便，造價較低，但換氣次數少，一般為10～50次/h，容易產生渦流，污染粒子可能在室內渦流區懸浮循環流動，形成污染氣流，降低室內凈化度。只適用于NASA標準中 10 000～1000 000級的凈化室。(2)層流系統(Laminal Flow System)；層流系統利用分布均勻和流速適當的氣流，將微粒、塵埃通過回風口帶出手術室，不產生渦流，故沒有浮動的塵埃，凈化度隨換氣次數的增加而提高，適用于美國宇航局標準中100級的手術室。但過濾器密封破損率比較大，且造價較高。

手術室墻面和天花板采用可隔音、堅實、光滑、無空隙、防火、防濕、易清潔的材料。顏色采用淡藍、淡綠為宜。墻角呈圓形，防止積灰。觀片燈及藥品柜、操作臺等應設在墻內。 門應寬大、無門檻，便于平車出進，應避免使用易擺動的彈簧門，以防氣流使塵土及細菌飛揚。窗應雙層，最好用鋁合金窗框，有利防塵保溫。窗玻璃以茶色為宜。走廊寬度應不少于2.5m，便于平車運轉及避免來往人員碰撞。地應采用堅硬、光滑易刷洗的材料建造。地面稍傾斜向一角，低處設地漏，利于排出污水，排水孔加蓋，以免污染空氣進入室內或被異物堵塞。